Generolas majoras J. V. Žukas savo tarnybą pradėjo 1990 metų birželį atkuriamos Lietuvos kariuomenės Krašto apsaugos departamento Antrojo skyriaus inspektoriumi. Tų pačių metų rudenį buvo paskirtas Krašto apsaugos departamento Kadrų skyriaus viršininku. Dirbdamas šį darbą, gen. mjr. Žukas prisidėjo kuriant Valstybės sienos apsaugos tarnybą Lietuvoje. 1991 m. sausio 8 d. Seime davė priesaiką Lietuvos Respublikai, gynė ją tragiškų sovietų agresijos įvykių 1991 m. sausį ir rugpjūtį metu.

Vėliau gen. mjr. J. V. Žukas dirbo Lauko kariuomenės brigados Kauno motodesantinio bataliono vadu, Motorizuotos pėstininkų brigados „Geležinis Vilkas“ vadu, Lietuvos gynybos atašė Vokietijos Federacinėje Respublikoje, Lietuvos kariuomenės Mokymo ir doktrinų valdybos vadu. 2007 m. rugsėjo 26 d. buvo paskirtas Lietuvos kariuomenės Sausumos pajėgų vadu. Nuo 2012 m. rugpjūčio 6 d. gen. mjr. J. V. Žukas eina garbingas LR Karinio atstovo prie NATO ir ES pareigas.

Generolo majoro karinis laipsnis J. V. Žukui suteiktas 2010 m. Jis yra baigęs mokslus Vilniaus universitete, Bundesvero vadovavimo akademijoje ir NATO gynybos koledže.

 Vienas iš nedaugelio LK vadų kuris savo karjeroje turi kuopos vado, bataliono vado, brigados vado, sausumos pajėgų vado ir NATO karininko patirtį.

Įvertinimai

Sausio 13-osios medalis (1992 m.).Lietuvos kariuomenės kūrėjų savanorių medalis (1995 m.).

Lietuvos nepriklausomybės medalis (2000 m.).

Lietuvos kariuomenės medalis „Už nuopelnus“

Vyčio Kryžiaus ordino Riterio kryžius (1998 m.).

Lietuvos stojimo į NATO medalis.

CISM (Tarptautinė karinio sporto taryba) ordinas už nuopelnus

dalis informacijos panaudota iš tinklalapio: http://yrasalis.lt/desimt/pareigunai/gen-mjr-jonas-vytautas-zukas/#sthash.QqsLBWhz.dpuf